Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPRD1AQ96P16 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms