Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM47Q96LD4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM47Q96LD4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms