Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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