Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SVOPQ8N4V2 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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