Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CLIP4Q8N3C7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CLIP4Q8N3C7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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