Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms