Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNMB4Q86W47 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms