Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms