Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SEMA4A-203ENST00000368284 2981 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DNAJC5G-201ENST00000296097 2008 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CYP4F35P-201ENST00000582957 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NR2E1-201ENST00000368983 2612 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AP003027.1-202ENST00000366160 2076 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LRRTM4-204ENST00000409884 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 VAV1-202ENST00000539284 2627 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MAP3K9-204ENST00000554146 2982 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms