Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms