Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NTRK2Q16620 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NTRK2Q16620 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NTRK2Q16620 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NTRK2Q16620 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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