Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GRIK5Q16478 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GRIK5Q16478 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GRIK5Q16478 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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