Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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