Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms