Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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