Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms