Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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