Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms