Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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