Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCIRG1Q13488 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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