Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms