Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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