Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBRQ0VD83 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms