Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms