Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNB3Q05901 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms