Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms