Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms