Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HBBP68871 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HBBP68871 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms