Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB4BP68371 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms