Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms