Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms