Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPD3P42695 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD3P42695 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms