Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms