Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms