Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms