Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMA5P28066 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA5P28066 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms