Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms