Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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