Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms