Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms