Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POMCP01189 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POMCP01189 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POMCP01189 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POMCP01189 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMCP01189 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMCP01189 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms