Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms