Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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