Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP104O60308 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP104O60308 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP104O60308 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP104O60308 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms