Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TO15178 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TO15178 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms