Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms