Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms