Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms