Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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