Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms